Sequencher for Mac 5.4.6

Mac үчүн Sequencher: ДНК ырааттуулугун анализдөөнүн эң сонун куралы

Эгер сиз жашоо илиминин изилдөөчүсү болсоңуз, анда сиздин карамагыңызда туура шаймандардын болушу канчалык маанилүү экенин билесиз. Ал эми ДНК ырааттуулугун талдоо жөнүндө сөз болгондо, Mac үчүн Sequencher'ден жакшы курал жок.

Sequencher – бул бардык автоматташтырылган ДНК секвенерлери менен иштеген билим берүү программасы жана өзүнүн чагылгандай тез контиг жыйындысы, кыска үйрөнүү ийри сызыгы, колдонуучуга ыңгайлуу түзөтүү куралдары жана мыкты техникалык колдоосу менен кеңири белгилүү. Алгачкы жолу дээрлик 15 жыл мурун чыгарылган Sequencher ар бир ири геномдук жана фармацевтикалык компанияларда, ошондой эле дүйнөнүн 40тан ашык өлкөлөрүндөгү көптөгөн академиялык жана мамлекеттик лабораторияларда ырааттуулукту талдоо тапшырмалары үчүн программалык камсыздоо болуп калды.

Бирок Sequencher эмнеси менен өзгөчө? Келгиле, анын мүмкүнчүлүктөрүн кененирээк карап көрөлү.

De Novo Gene Sequencing

ДНК ырааттуулугун анализдөөнүн эң кеңири таралган колдонмолорунун бири гендердин секвенциясы де-ново болуп саналат. Бул чийки секвенирлөө маалыматтарынын негизинде нөлдөн баштап толук генди чогултууну камтыйт. Sequencher менен, бул процесс эң татаал ырааттуулуктарды да чече алган күчтүү контиг чогултуу алгоритмдеринин аркасында жеңилдетилген.

Мутацияны аныктоо

ДНК ырааттуулугун анализдөөнүн дагы бир маанилүү колдонмосу - мутацияны аныктоо. Ооруларды пайда кылуучу мутацияларды издеп жатасызбы же ар кандай популяциялардын ортосундагы генетикалык вариацияларды аныктоого аракет кылып жатасызбы, Sequencher сизди анын гетерозигота жана SNP аныктоо жана анализдөө мүмкүнчүлүктөрүн камтыйт.

Адамдын соттук идентификациясы

Соттук-медициналык илимде ДНК секвенциясы адамдын сөөктөрүн же кылмышка шектүүлөрдү аныктоодо чечүүчү ролду ойнойт. Sequencher'дин ишеним упайларын жана GenBank функцияларын импорттоо үчүн колдоосу менен криминалисттер потенциалдуу дал келүүлөрдү аныктоо үчүн секвенирлөөнүн чоң көлөмүн тез талдай алышат.

Салыштырмалуу ырааттуулук

Салыштырмалуу ырааттуулук алардын ортосундагы окшоштуктарды жана айырмачылыктарды аныктоо үчүн эки же андан көп ырааттуулукту салыштырууну камтыйт. Бул изилдөөчүлөр ар кандай түрлөр же штаммдар боюнча генетикалык ырааттуулуктарды салыштыруу керек болгон эволюциялык биология же дары-дармектердин ачылышы сыяктуу тармактарда пайдалуу болушу мүмкүн. Sequencher'тин салыштырма секвенирлөө мүмкүнчүлүктөрү менен бул процесс бир топ жеңил жана натыйжалуу болуп калат.

Ишеним упайларын колдоо

Ишенимдүүлүк упайлары маалыматтарды ырааттуулукту талдоодо көптөгөн изилдөөчүлөр тарабынан колдонулган маанилүү көрсөткүч. Бул упайлар сапат упайлары же окуу тереңдиги сыяктуу ар кандай факторлордун негизинде белгилүү бир базалык чалуу же тегиздөө туура экенине канчалык ишенерин көрсөтөт. Өзүнүн алгоритмдеринде орнотулган ишеним упайларынын колдоосу менен Sequnecer жогорку деңгээлдеги тактыкты сактоо менен чоң көлөмдөгү маалыматтарды анализдөөнү жеңилдетет.

ORF Translation

Ачык окуу рамкалары (ORFs) белокторду коддогон гендин ичиндеги нуклеотиддердин узундугу. Геномдун ичиндеги ORFдерди аныктоо кыйынга турушу мүмкүн, бирок Sequnecerдин ORF котормо мүмкүнчүлүктөрү менен изилдөөчүлөр бул аймактарды гендин функциясын жакшыраак түшүнүүгө мүмкүндүк берген ырааттуулуктун ичинде оңой таба алышат.

GenBank Feature Import

GenBank функциялары гендер жөнүндө баалуу маалыматты, анын ичинде хромосомалардын ичиндеги жайгашкан жерин жана башка аннотацияларды, мисалы, экзондор/интрондор ж.б. камсыз кылат. Бул функцияларды Sequnecerге импорттоо менен колдонуучулар алардын тизмектери жөнүндө кошумча маалыматка ээ болушат, бул аларга праймер сыяктуу ылдыйкы анализдер учурунда көбүрөөк негизделген чечимдерди кабыл алууга жардам берет. дизайн ж.б.

Чектөө энзиминин картасы

Чектөөчү ферменттер эки тилкелүү ДНКны белгилүү бир таануу жерлеринде кесип, геномдук структураны/функцияны изилдөөдө аларды пайдалуу куралга айлантат. жана башкалар..

Жыйынтык:

Жыйынтыктап айтканда, эгер сиз жашоо илимиңизди изилдөөнү тартипке келтирүүгө жардам бере турган билим берүүчү программалык камсыздоону издеп жатсаңыз, анда Sequnecerден башканы издебеңиз! Анын күчтүү алгоритмдери колдонуучуга ыңгайлуу интерфейс менен айкалышып, тажрыйбалуу изилдөөчүлөргө керектүү өркүндөтүлгөн функцияларды камсыз кылуу менен, жада калса жаңы баштаган колдонуучуларды да тез баштоону жеңилдетет. Анда эмне үчүн күтө туруңуз? Көчүрмөңүздү бүгүн жүктөп алыңыз!