| Нускасы | 1.12.1 |
|---|---|
| Publisher | Unipro |
| Чыккан датасы | 2013-ж., 16-июл. |
| Кошулган күнү | 2013-ж., 16-июл. |
| Os талаптар | Windows, Windows XP, Windows Vista, Windows 7 |
| Талаптар | None |
| Жалпы жүктөлүүлөр | 1 858 |
| Баасы | Free |
Сүрөттөмө
Unipro UGENE – бул ДНК жана протеин ырааттуулугун анализдөө үчүн акысыз визуалдык программалык камсыздоо. UGENE визуализация, талдоо, генетикалык ырааттуулуктарды аннотациялоо үчүн ыңгайлаштырылган куралдар менен камсыз кылат. Негизги өзгөчөлүктөр: интегралдык MUSCLE тегиздөө куралы, Integrated HMMER2 пакети, PDB макромолекулярдык структуралар үчүн OpenGL көрүүчүсү жана ыңгайлаштырылган эсептөө иш процесстерин түзүү жана аткаруу үчүн Workflow Designer.
Review
Unipro компаниясынын Ugene акысыз биоинформатика моделдөө жана визуалдаштыруу куралы болуп саналат. Сиз аны ДНК менен протеин тизмегин визуализациялоо, талдоо жана аннотациялоо үчүн колдоно аласыз. Ал ар кандай платформалар, инструменттер жана методдор менен кеңири шайкеш келет жана интегралдык булчуңдарды тегиздөө куралын, интеграцияланган Hmmer2 пакетин, PDB макромолекулярдык структуралары үчүн OpenGL көрүүчүнү жана ыңгайлаштырылган иш процессинин дизайнерин камтыйт.
Ugene орнотуу кыйын эмес, бирок анын аткарган ишинин көбү башка файлдарга жана куралдарга кирүү мүмкүнчүлүгүнөн көз каранды. Ugene функциялары Долбоорлор, Тапшырмалар жана Журналдарга негизделген. Колдонмонун Орнотууларынын астында биз система ресурстарын бөлүштүрүүдөн баштап OpenGL жана CUDA жөндөөлөрүнө чейин (Nvidia графикалык карталары үчүн гана) баарын конфигурациялай алабыз. Тышкы куралдар менюсу бизге Ugeneге Blast, Bowtie, ClusatlW, MrBayes жана T-Coffee сыяктуу шайкеш келген генетикалык маалымат куралдары менен кантип иштешерин орнотууга мүмкүндүк берет. Алыскы машина мониторунун параметри да бар.
Биз Угене менен бат эле башыбызга түшүп калдык, бирок программаны кандайдыр бир жол менен колдонуу кыйынга тургандыктан эмес, бизде эки маанилүү нерсе жок болгондуктан: генетика боюнча деталдуу билим жана учурдагы тизмектерге, моделдерге жана маалыматтарга жетүү. Биз аракет кылган куралдардын көбү визуализацияларды түзүү үчүн маалыматтарды талап кылат жана программанын талдоо функциялары талдоо үчүн бир нерсени талап кылат. Бирок Ugene ошондой эле PDF негизиндеги колдонуучу колдонмосунан баштап жергиликтүү жана онлайн бир топ документтерди жана жардамды сунуш кылат. Ugene ошондой эле Workflow Designer Manual жана Query Designer Manual камтыйт. Анын веб-сайты жамааттык форумду, онлайн колдоону жана акысыз жана коммерциялык колдоо кызматтарын сунуштайт, андыктан жакыр студенттерден баштап мыкты лабораторияларга чейин бардыгы үчүн бир нерсе бар. Биз Угененин илимпоздорго жана студенттерге биологиянын эң алдыңкы чегинде ийкемдүү, бекер генетикалык моделдөө чечимин берүү жөндөмдүүлүгүнө таң калдык. Ugene'ди жакшы колдоно алган колдонуучулардын көбү анын окуулары же изилдөөлөрү үчүн эмне кыла аларын бир карап көрө алышат.
