ZOOM Lite

Сүрөттөмө

ZOOM Lite - бул кийинки муундагы маалыматтарды картага түшүрүү жана визуалдаштыруу программасы. Колдонуучулар шилтеме геномдорун жана Illumina/Solexa кыска файлдарын окушат же AB SOLiD түс мейкиндиги * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta ж.б. сыяктуу ар кандай форматтагы файлдарды окуйт. шилтеме тизмеги боюнча окуйт. ZOOM Lite жаңы иштелип чыккан бир нече аралыкта жайгашкан үрөндөр теориясынын негизинде картага түшүрүүнүн тез жана так ядросуна ээ. 15bp ден 240bp чейин ар кандай узундуктагы бир-аяктагы жана эки-экиден окулган окууга болот. Шилтемелердин ар кандай дал келбестигине жана окулган менен анын максаттуу аймагынын ар кандай узундугун бир киргизүүгө/өчүрүүгө уруксат берилет. Ар бир окуу үчүн уникалдуу картага алынган натыйжалар же мыкты (жогорку N) натыйжалар минималдуу дал келбестиктерге жана инделдин узундугуна ылайык кабарланат. Картанын тактыгын жогорулатуу үчүн сапат упайлары колдонулат. Картага келтирүү ядросунун негизинде ZOOM Lite колдонуучуларга жергиликтүү окулган маалыматтарды жана маалымдама ырааттуулук маалыматтарын жүктөөгө, туура параметрлерди тандап алууга, жогорку көлөмдөгү маалыматты төрт CPU чейин параллель иштетүүгө, иштеп жаткан тапшырмаларды көзөмөлдөөгө, картага түшүрүүнүн натыйжаларын сактоого, UCSC браузеринин трек маалыматы менен андан ары сурамжылоо жүргүзүү үчүн * .BED же * .GFF файл форматтарында картага түшүрүүнүн натыйжаларын жана картага түшүрүүнүн натыйжаларын. Картага түшүрүүнүн натыйжаларын каалаган масштабда, бүтүндөй хромосоманын тереңдик графигинен баштап, окуулар менен шилтеме тизмегинин ортосундагы ырааттуу ырааттуулукка чейин көрүүгө болот. Колдонуучулар кызыктуу аймактарга чыкылдатуу, сүйрөө же жылдыруу аркылуу оңой багыт алышат. ZOOM Lite - ZOOM Studio программасынын туундусу.